Phần mềm theo dõi và phân tích giun WormLab – MicroBrightfield

Mô tả

Phần mềm theo dõi và phân tích giun WormLab

Hãng: MicroBrightField

Model: WormLab

WormLab là phần mềm dùng để ghi hình, theo dõi và phân tích giun C. elegans cùng các loài giun khác. Phần mềm sở hữu giao diện thân thiện với người dùng kết hợp thuật toán theo dõi chuyên biệt mạnh mẽ, cho phép thu thập dữ liệu về một hoặc nhiều cá thể giun, ngay cả khi chúng uốn cong hình omega, di chuyển lùi hoặc quấn vào nhau. Thuật toán này có khả năng phân tích hầu như mọi định dạng tệp video, bao gồm .avi, .wmv và .mp4.

WormLab mang đến nhiều lựa chọn phân tích chính xác về một hoặc nhiều cá thể giun, sở hữu giao diện trực quan với quy trình làm việc rõ ràng, đồng thời đi kèm sự hỗ trợ kỹ thuật và nghiên cứu từ MicroBightField.

ƯU ĐIỂM NỔI BẬT

• Định lượng chính xác hành vi của giun C. elegans hoàn toàn tự động
• Phân tích kiểu hình với độ chính xác cao — nhận diện dễ dàng và hiệu quả ngay cả những khác biệt nhỏ nhất
• Nhanh chóng thu thập dữ liệu có ý nghĩa nhờ quy trình làm việc thân thiện với người dùng của WormLab
• Tích hợp đánh giá hành vi với việc tạo kích thích, bao gồm quang di truyền học, hóa hướng động và cảm giác cơ học

ĐẶC TÍNH CHÍNH

1. Định lượng hoàn toàn tự động hành vi của một hay nhiều cá thể giun

Theo dõi và định lượng chính xác tập tính di chuyển như tốc độ, khoảng cách, hướng di chuyển cũng như các chuyển động phức tạp như cuộn tròn, quấn vào nhau, cuộn hình omega hay tự chồng lấp.

2. Quy trình trực quan – Thu nhận, theo dõi và phân tích

• Quy trình phần mềm hướng dẫn theo từng bước để thu nhận, theo dõi và phân tích dữ liệu hình ảnh từ thiết bị thu nhận hình ảnh Wormlab hoặc thiết bị thu nhận hình ảnh của bạn.
• Video thu được sử dụng thiết bị thu nhận hình ảnh Wormlab lập tức được sử dụng để theo dõi và phân tích hoặc bạn có thể đưa các video thu nhận trước đó vào phần mềm Wormlab để phân tích.
• Phần mềm Wormlab sẽ tự động phát hiện giun, theo dõi chính xác chuyển động của giun và hiển thị dữ liệu theo dõi theo định dạng biểu đồ trực quan dưới dạng bảng có thể tùy chỉnh theo ý người dùng.

3. Tùy chọn hiển thị đường viền cơ thể giun, vết chuyển động của điểm giữa, điểm đánh dấu đầu/đuôi.

• Dễ dàng hiển thị, chia sẽ và đánh giá các kết quả theo dõi tự động được đặt chồng lên đoạn video gốc.
• Tính năng tự động nhận diện đầu của Wormlab tận dụng dữ liệu biên độ uốn cong ở gần các điểm mút của giun, hình thái học cơ thể và hướng chuyển động nhằm nâng cao độ chính xác trong việc nhận diện ngay cả ở các video độ phân giải thấp.

4. Mô hình bơi nâng cao giúp mở rộng khả năng thí nghiệm

Phân tích hành vi của C. elegans đang bơi cung cấp thêm nhiều thông tin mới cho nghiên cứu về lão hóa và bệnh thoái hóa thần kinh.

5. Tạo kích thích tự động cho các thí nghiệm quang di truyền và cảm giác cơ học.

Wormlab cho phép dễ dàng liên hệ hành vi với những kích thích ánh sáng hay gõ nhẹ hoàn toàn tự động, nâng cao tính hiệu quả và khả năng lặp lại của thí nghiệm.

6. Công cụ tích hợp cho các ứng dụng thông lượng cao

• Theo dõi theo lô cho phép nạp hàng loạt video để xử lý tự động mà không cần người can thiệp (vd. qua đêm). Dữ liệu sẽ được lưu tự động và sẵn sàng cho phân tích ngay khi người sử dụng quay lại lab.
• Với công cụ Group Analytics sẵn có, có thể dễ dàng so sánh xu hướng giữa các nhóm người sử dụng trên nhiều bộ dữ liệu. Xuất theo lô cho phép tiếp cận hiệu quả đến tất cả dữ liệu của bất kỳ phân tích tùy chỉnh nào.