Công nghệ đồng phát hiện bằng mã vạch CODEX (Co-Detection by indEXing)

Công nghệ đồng phát hiện bằng mã vạch CODEX (Co-Detection by indEXing) được phát triển dựa trên kết quả nghiên cứu từ phòng lab của Tiến sĩ Garry Nolan tại Đại học Stanford, công nghệ này sử dụng các kháng thể liên hợp với các trình tự oligonucleotide đặc hiệu gọi là bộ mã vạch (CODEX-Barcodes).

Hình 1: Các thành phần chính của công nghệ CODEX:

• Kháng thể CODEX (CODEX Antibodies) là các kháng thể liên hợp dùng để tạo panel kháng thể.
• Trình diện CODEX (CODEX Reporters) là các oligonucleotide gắn fluorophore để trình diện kháng thể CODEX.
• Mã vạch CODEX (CODEX Barcodes) là Các trình tự Oligonucleotide đã được kích hoạt cho sự liên kết dễ dàng vớicác Kháng thể – CODEX tùy chỉnh

Trong phản ứng CODEX, các kháng thể gắn với Trình diện CODEX (CODEX-Reporter)  bằng cách bắt cặp bổ sung với trình tự oligonucleotide. Sau khi mô được nhuộm với toàn bộ bộ kháng thể CODEX trong một bước duy nhất, 3 trình diện CODEX được thêm vào trong mỗi chu kỳ để biểu hiện 3 điểm đánh dấu cùng một lúc. Sau mỗi chu kỳ, các trình diện CODEX được nhẹ nhàng gỡ bỏ, rửa sạch và chu trình lặp lại cho đến khi tất cả các điểm đánh dấu trong bộ dấu ấn sinh học được biểu hiện. Quy trình biểu hiện, chụp ảnh và loại bỏ trình diện theo chu kỳ này hoàn toàn tự động trên hệ thống đọc và phân tích miễn dịch huỳnh quang đa dấu ấn sinh học CODEX®.

Hình 2: Bước 1 – Nhuộm: Nhuộm một bước duy trì tính toàn vẹn của mẫu và giảm thiểu  thời gian làm thay đổi kháng thể. Việc nhuộm kháng thể trên mô được thực hiện trước khi chạy hệ thống CODEX.

Hình 3: Bước 2 – Biểu hiện: Sau khi mô được nhuộm bằng hỗn hợp kháng thể, mẫu được nạp vào Hệ thống CODEX và chu trình Biểu hiện – Chụp ảnh – Loại bỏ bắt đầu. Ba trình diện CODEX được thêm vào mỗi chu kỳ.

Hình 4: Bước 3 – Chụp ảnh: Mỗi trình diện huỳnh quang được chụp ảnh riêng biệt

Hình 5: Bước 4 – Loại bỏ: Sau khi thu nhận hình ảnh, các trình diện CODEX được rửa bỏ, cho phép 3 trình diện CODEX tiếp theo hiển thị, và chu trình này được lặp lại cho đến toàn bộ các dấu ấn được biểu hiện

Hình 6: Bước 5 – Lặp lại: Hệ thống CODEX hỗ trợ thực hiện tự động hóa chu trình Biểu hiện- Chụp ảnh – Loại bỏ, để mỗi lần chạy có thể tạo ra  dữ liệu protein trong cấu trúc không gian tế bào của hơn hơn 40 dấu ấn sinh học.

Hình 7: Bước 6 – Phân tích: Sau khi dữ liệu hình ảnh đa màu được thu thập, người dùng có thể phân tích kiểu hình tế bào bằng bộ phần mềm CODEX Software Suite. 

Đặc điểm nổi bật của Công nghệ đồng phát hiện bằng mã vạch CODEX

• Cho phép tùy chỉnh lên đến hơn 40 Kháng thể CODEX được kết hợp trên cùng một bản nhuộm lam kính mà không bị nhiễu.
• Nhuộm một bước và loại bỏ fluorophore nhẹ nhàng nhằm bảo quản mẫu để phân tích vùng quan tâm (ROI)
• Đơn giản, hệ thống chất lỏng để bàn có hiệu quả về chi phí và đơn giản để thực hiện trong bất kỳ phòng thí nghiệm nghiên cứu nào

Xem thêm sản phẩm của hãng Akoya tại đây.